mirror of https://github.com/OpenIdentityPlatform/OpenDJ.git

Jean-Noel Rouvignac
22.23.2014 25862fdf888ed23207ab51937a43e6f9ad41d805
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
1001
1002
1003
1004
1005
1006
1007
1008
1009
1010
1011
1012
1013
1014
1015
1016
1017
1018
1019
1020
1021
1022
1023
1024
1025
1026
1027
1028
1029
1030
1031
1032
1033
1034
1035
1036
1037
1038
1039
1040
1041
1042
1043
1044
1045
1046
1047
1048
1049
1050
1051
1052
1053
1054
1055
1056
1057
1058
1059
1060
1061
1062
1063
1064
1065
1066
1067
1068
1069
1070
1071
1072
1073
1074
1075
1076
1077
1078
1079
1080
1081
1082
1083
1084
1085
1086
1087
1088
1089
1090
1091
1092
1093
1094
1095
1096
1097
1098
1099
1100
1101
1102
1103
1104
1105
1106
1107
1108
1109
1110
1111
1112
1113
1114
1115
1116
1117
1118
1119
1120
1121
1122
1123
1124
1125
1126
1127
1128
1129
1130
1131
1132
1133
1134
1135
1136
1137
1138
1139
1140
1141
1142
1143
1144
1145
1146
1147
1148
1149
1150
1151
1152
1153
1154
1155
1156
1157
1158
1159
1160
1161
1162
1163
1164
1165
1166
1167
1168
1169
1170
1171
1172
1173
1174
1175
1176
1177
1178
1179
1180
1181
1182
1183
1184
1185
1186
1187
1188
1189
1190
1191
1192
1193
1194
1195
1196
1197
1198
1199
1200
1201
1202
1203
1204
1205
1206
1207
1208
1209
1210
1211
1212
1213
1214
1215
1216
1217
1218
1219
1220
1221
1222
1223
1224
1225
1226
1227
1228
1229
1230
1231
1232
1233
1234
1235
1236
1237
1238
1239
1240
1241
1242
1243
1244
1245
1246
1247
1248
1249
1250
1251
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258
1259
1260
1261
1262
1263
1264
1265
1266
1267
1268
1269
1270
1271
1272
1273
1274
1275
1276
1277
1278
1279
1280
1281
1282
1283
1284
1285
1286
1287
1288
1289
1290
1291
1292
1293
1294
1295
1296
1297
1298
1299
1300
1301
1302
1303
1304
1305
1306
1307
1308
1309
1310
1311
1312
1313
1314
1315
1316
1317
1318
1319
1320
1321
1322
1323
1324
1325
1326
1327
1328
1329
1330
1331
1332
1333
1334
1335
1336
1337
1338
1339
1340
1341
1342
1343
1344
1345
1346
1347
1348
1349
1350
1351
1352
1353
1354
1355
1356
1357
1358
1359
1360
1361
1362
1363
1364
1365
1366
1367
1368
1369
1370
1371
1372
1373
1374
1375
1376
1377
1378
1379
1380
1381
1382
1383
1384
1385
1386
1387
1388
1389
1390
1391
1392
1393
1394
1395
1396
1397
1398
1399
1400
1401
1402
1403
1404
1405
1406
1407
1408
1409
1410
1411
1412
1413
1414
1415
1416
1417
1418
1419
1420
1421
1422
1423
1424
1425
1426
1427
1428
1429
1430
1431
1432
1433
1434
1435
1436
1437
1438
1439
1440
1441
1442
1443
1444
1445
1446
1447
1448
1449
1450
1451
1452
1453
1454
1455
1456
1457
1458
1459
1460
1461
1462
1463
1464
1465
1466
1467
1468
1469
1470
1471
1472
1473
1474
1475
1476
1477
1478
1479
1480
1481
1482
1483
1484
1485
1486
1487
1488
1489
1490
1491
1492
1493
1494
1495
1496
1497
1498
1499
1500
1501
1502
1503
1504
1505
1506
1507
1508
1509
1510
1511
1512
1513
1514
1515
1516
1517
1518
1519
1520
1521
1522
1523
1524
1525
1526
1527
1528
1529
1530
1531
1532
1533
1534
1535
1536
1537
1538
1539
1540
1541
1542
1543
1544
1545
1546
1547
1548
1549
1550
1551
1552
1553
1554
1555
1556
1557
1558
1559
1560
1561
1562
1563
1564
1565
1566
1567
1568
1569
1570
1571
1572
1573
1574
1575
1576
1577
1578
1579
1580
1581
1582
1583
1584
1585
1586
1587
1588
1589
1590
1591
1592
1593
1594
1595
1596
1597
1598
1599
1600
1601
1602
1603
1604
1605
1606
1607
1608
1609
1610
1611
1612
1613
1614
1615
1616
1617
1618
1619
1620
1621
1622
1623
1624
1625
1626
1627
1628
1629
1630
1631
1632
1633
1634
1635
1636
1637
1638
1639
1640
1641
1642
1643
1644
1645
1646
1647
1648
1649
1650
1651
1652
1653
1654
1655
1656
1657
1658
1659
1660
1661
1662
1663
1664
1665
1666
1667
1668
1669
1670
1671
1672
1673
1674
1675
1676
1677
1678
1679
1680
1681
1682
1683
1684
1685
1686
1687
1688
1689
1690
1691
1692
1693
1694
1695
1696
1697
1698
1699
1700
1701
1702
1703
1704
1705
1706
1707
1708
1709
1710
1711
1712
1713
1714
1715
1716
1717
1718
1719
1720
1721
1722
1723
1724
1725
1726
1727
1728
1729
1730
1731
1732
1733
1734
1735
1736
1737
1738
1739
1740
1741
1742
1743
1744
1745
1746
1747
1748
1749
1750
1751
1752
1753
1754
1755
1756
1757
1758
1759
1760
1761
1762
1763
1764
1765
1766
1767
1768
1769
1770
1771
1772
1773
1774
/*
 * CDDL HEADER START
 *
 * The contents of this file are subject to the terms of the
 * Common Development and Distribution License, Version 1.0 only
 * (the "License").  You may not use this file except in compliance
 * with the License.
 *
 * You can obtain a copy of the license at legal-notices/CDDLv1_0.txt
 * or http://forgerock.org/license/CDDLv1.0.html.
 * See the License for the specific language governing permissions
 * and limitations under the License.
 *
 * When distributing Covered Code, include this CDDL HEADER in each
 * file and include the License file at legal-notices/CDDLv1_0.txt.
 * If applicable, add the following below this CDDL HEADER, with the
 * fields enclosed by brackets "[]" replaced with your own identifying
 * information:
 *      Portions Copyright [yyyy] [name of copyright owner]
 *
 * CDDL HEADER END
 *
 *
 *      Copyright 2006-2010 Sun Microsystems, Inc.
 *      Portions Copyright 2011-2014 ForgeRock AS
 *      Portions Copyright 2014 Manuel Gaupp
 */
package org.opends.server.backends.jeb;
 
import java.util.*;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicBoolean;
 
import org.forgerock.i18n.LocalizableMessage;
import org.forgerock.i18n.LocalizableMessageBuilder;
import org.forgerock.i18n.slf4j.LocalizedLogger;
import org.forgerock.opendj.config.server.ConfigException;
import org.forgerock.opendj.ldap.Assertion;
import org.forgerock.opendj.ldap.ByteString;
import org.forgerock.opendj.ldap.DecodeException;
import org.forgerock.opendj.ldap.ResultCode;
import org.forgerock.opendj.ldap.spi.IndexQueryFactory;
import org.forgerock.opendj.ldap.spi.IndexingOptions;
import org.forgerock.util.Utils;
import org.opends.server.admin.server.ConfigurationChangeListener;
import org.opends.server.admin.std.meta.LocalDBIndexCfgDefn.IndexType;
import org.opends.server.admin.std.server.LocalDBIndexCfg;
import org.opends.server.api.ExtensibleIndexer;
import org.opends.server.api.ExtensibleMatchingRule;
import org.opends.server.api.MatchingRule;
import org.opends.server.core.DirectoryServer;
import org.opends.server.monitors.DatabaseEnvironmentMonitor;
import org.opends.server.types.*;
import org.opends.server.util.StaticUtils;
 
import com.sleepycat.je.DatabaseEntry;
import com.sleepycat.je.DatabaseException;
import com.sleepycat.je.Environment;
import com.sleepycat.je.Transaction;
 
import static org.opends.messages.JebMessages.*;
import static org.opends.server.util.ServerConstants.*;
import static org.opends.server.util.StaticUtils.*;
 
/**
 * Class representing an attribute index.
 * We have a separate database for each type of indexing, which makes it easy
 * to tell which attribute indexes are configured.  The different types of
 * indexing are equality, presence, substrings and ordering.  The keys in the
 * ordering index are ordered by setting the btree comparator to the ordering
 * matching rule comparator.
 * Note that the values in the equality index are normalized by the equality
 * matching rule, whereas the values in the ordering index are normalized
 * by the ordering matching rule.  If these could be guaranteed to be identical
 * then we would not need a separate ordering index.
 */
public class AttributeIndex
    implements ConfigurationChangeListener<LocalDBIndexCfg>
{
  private static final LocalizedLogger logger = LocalizedLogger.getLoggerForThisClass();
 
  /*
   * FIXME Matthew Swift: Once the matching rules have been migrated we should
   * revisit this class. IMO the core indexes (equality, etc) should all be
   * treated in the same way as extensible indexes. In other words, there should
   * be one table mapping index ID to index and one IndexQueryFactory. Matching
   * rules should then be able to select which indexes they need to use when
   * evaluating searches, and all index queries should be processed using the
   * IndexQueryFactory implementation. Moreover, all of the evaluateXXX methods
   * should go (the Matcher class in the SDK could implement the logic, I hope).
   * That's the theory at least...
   */
 
  /**
   * A database key for the presence index.
   */
  public static final DatabaseEntry presenceKey =
       new DatabaseEntry("+".getBytes());
 
  /**
   * The entryContainer in which this attribute index resides.
   */
  private EntryContainer entryContainer;
  private Environment env;
  private State state;
 
  /**
   * The attribute index configuration.
   */
  private LocalDBIndexCfg indexConfig;
 
  /** The mapping from names to indexes. */
  private final Map<String, Index> nameToIndexes;
  private final IndexQueryFactory<IndexQuery> indexQueryFactory;
 
  /**
   * The ExtensibleMatchingRuleIndex instance for ExtensibleMatchingRule
   * indexes.
   */
  private ExtensibleMatchingRuleIndex extensibleIndexes;
  private int cursorEntryLimit = 100000;
 
  /**
   * Create a new attribute index object.
   *
   * @param entryContainer The entryContainer of this attribute index.
   * @param state The state database to persist index state info.
   * @param env The JE environment handle.
   * @param indexConfig The attribute index configuration.
   * @throws DatabaseException if a JE database error occurs.
   * @throws ConfigException if a configuration related error occurs.
   */
  public AttributeIndex(LocalDBIndexCfg indexConfig, State state,
                        Environment env, EntryContainer entryContainer)
      throws DatabaseException, ConfigException
  {
    this.entryContainer = entryContainer;
    this.env = env;
    this.indexConfig = indexConfig;
    this.state = state;
    nameToIndexes = new HashMap<String, Index>();
 
    AttributeType attrType = indexConfig.getAttribute();
    String name = entryContainer.getDatabasePrefix() + "_" + attrType.getNameOrOID();
    final int indexEntryLimit = indexConfig.getIndexEntryLimit();
    final JEIndexConfig config = new JEIndexConfig(indexConfig.getSubstringLength());
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.EQUALITY))
    {
      Index equalityIndex = buildExtIndex(name, attrType, indexEntryLimit,
          attrType.getEqualityMatchingRule(), new EqualityIndexer(attrType));
      nameToIndexes.put(IndexType.EQUALITY.toString(), equalityIndex);
    }
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.PRESENCE))
    {
      Index presenceIndex = newIndex(name + "." + IndexType.PRESENCE.toString(),
          indexEntryLimit, new PresenceIndexer(attrType));
      nameToIndexes.put(IndexType.PRESENCE.toString(), presenceIndex);
    }
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.SUBSTRING))
    {
      Index substringIndex = buildExtIndex(name, attrType, indexEntryLimit,
          attrType.getSubstringMatchingRule(), new SubstringIndexer(attrType));
      nameToIndexes.put(IndexType.SUBSTRING.toString(), substringIndex);
    }
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.ORDERING))
    {
      Index orderingIndex = buildExtIndex(name, attrType, indexEntryLimit,
          attrType.getOrderingMatchingRule(), new OrderingIndexer(attrType));
      nameToIndexes.put(IndexType.ORDERING.toString(), orderingIndex);
    }
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.APPROXIMATE))
    {
      Index approximateIndex = buildExtIndex(name, attrType, indexEntryLimit,
          attrType.getApproximateMatchingRule(), new ApproximateIndexer(attrType));
      nameToIndexes.put(IndexType.APPROXIMATE.toString(), approximateIndex);
    }
 
    indexQueryFactory = new IndexQueryFactoryImpl(nameToIndexes, config);
 
    if (indexConfig.getIndexType().contains(IndexType.EXTENSIBLE))
    {
      Set<String> extensibleRules = indexConfig.getIndexExtensibleMatchingRule();
      if(extensibleRules == null || extensibleRules.isEmpty())
      {
        throw new ConfigException(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "extensible"));
      }
      extensibleIndexes = new ExtensibleMatchingRuleIndex();
 
      // Iterate through the Set and create the index only if necessary.
      // Collation equality and Ordering matching rules share the same
      // indexer and index.
      // A Collation substring matching rule is treated differently
      // as it uses a separate indexer and index.
      for(String ruleName:extensibleRules)
      {
        ExtensibleMatchingRule rule = DirectoryServer.getExtensibleMatchingRule(toLowerCase(ruleName));
        if(rule == null)
        {
          logger.error(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_VALID_MATCHING_RULE, attrType, ruleName);
          continue;
        }
        Map<String,Index> indexMap = new HashMap<String,Index>();
        for (ExtensibleIndexer indexer : rule.getIndexers())
        {
          String indexID = attrType.getNameOrOID() + "." + indexer.getIndexID();
          if(!extensibleIndexes.isIndexPresent(indexID))
          {
            //There is no index available for this index id. Create a new index.
            String indexName = entryContainer.getDatabasePrefix() + "_" + indexID;
            Index extIndex = newExtensibleIndex(indexName, attrType, indexEntryLimit, indexer);
            extensibleIndexes.addIndex(extIndex, indexID);
          }
          extensibleIndexes.addRule(indexID, rule);
          indexMap.put(indexer.getExtensibleIndexID(), extensibleIndexes.getIndex(indexID));
        }
        IndexQueryFactory<IndexQuery> factory = new IndexQueryFactoryImpl(indexMap, config);
        extensibleIndexes.addQueryFactory(rule, factory);
      }
    }
  }
 
  private Index newIndex(String indexName, int indexEntryLimit, Indexer indexer)
  {
    return new Index(indexName, indexer, state, indexEntryLimit,
        cursorEntryLimit, false, env, entryContainer);
  }
 
  private Index buildExtIndex(String name, AttributeType attrType,
      int indexEntryLimit, MatchingRule rule, ExtensibleIndexer extIndexer) throws ConfigException
  {
    if (rule == null)
    {
      throw new ConfigException(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(
          attrType, extIndexer.getExtensibleIndexID()));
    }
 
    final String indexName = name + "." + extIndexer.getExtensibleIndexID();
    return newExtensibleIndex(indexName, attrType, indexEntryLimit, extIndexer);
  }
 
  private Index newExtensibleIndex(String indexName, AttributeType attrType,
      int indexEntryLimit, ExtensibleIndexer extIndexer)
  {
    JEExtensibleIndexer indexer = new JEExtensibleIndexer(attrType, extIndexer);
    return newIndex(indexName, indexEntryLimit, indexer);
  }
 
  /**
   * Open the attribute index.
   *
   * @throws DatabaseException if a JE database error occurs while
   * opening the index.
   */
  public void open() throws DatabaseException
  {
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.open();
    }
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        extensibleIndex.open();
      }
    }
 
    indexConfig.addChangeListener(this);
  }
 
  /**
   * Close the attribute index.
   *
   * @throws DatabaseException if a JE database error occurs while
   * closing the index.
   */
  public void close() throws DatabaseException
  {
    Utils.closeSilently(nameToIndexes.values());
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      Utils.closeSilently(extensibleIndexes.getIndexes());
    }
 
    indexConfig.removeChangeListener(this);
    // The entryContainer is responsible for closing the JE databases.
  }
 
  /**
   * Get the attribute type of this attribute index.
   * @return The attribute type of this attribute index.
   */
  public AttributeType getAttributeType()
  {
    return indexConfig.getAttribute();
  }
 
  /**
   * Return the indexing options of this AttributeIndex.
   *
   * @return the indexing options of this AttributeIndex.
   */
  public IndexingOptions getIndexingOptions()
  {
    return indexQueryFactory.getIndexingOptions();
  }
 
  /**
   * Get the JE index configuration used by this index.
   * @return The configuration in effect.
   */
  public LocalDBIndexCfg getConfiguration()
  {
    return indexConfig;
  }
 
  /**
   * Update the attribute index for a new entry.
   *
   * @param buffer The index buffer to use to store the added keys
   * @param entryID     The entry ID.
   * @param entry       The contents of the new entry.
   * @return True if all the index keys for the entry are added. False if the
   *         entry ID already exists for some keys.
   * @throws DatabaseException If an error occurs in the JE database.
   * @throws DirectoryException If a Directory Server error occurs.
   */
  public boolean addEntry(IndexBuffer buffer, EntryID entryID, Entry entry)
       throws DatabaseException, DirectoryException
  {
    boolean success = true;
 
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      if (!index.addEntry(buffer, entryID, entry, options))
      {
        success = false;
      }
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        if (!index.addEntry(buffer, entryID, entry, options))
        {
          success = false;
        }
      }
    }
 
    return success;
  }
 
  /**
   * Update the attribute index for a new entry.
   *
   * @param txn         The database transaction to be used for the insertions.
   * @param entryID     The entry ID.
   * @param entry       The contents of the new entry.
   * @return True if all the index keys for the entry are added. False if the
   *         entry ID already exists for some keys.
   * @throws DatabaseException If an error occurs in the JE database.
   * @throws DirectoryException If a Directory Server error occurs.
   */
  public boolean addEntry(Transaction txn, EntryID entryID, Entry entry)
       throws DatabaseException, DirectoryException
  {
    boolean success = true;
 
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      if (!index.addEntry(txn, entryID, entry, options))
      {
        success = false;
      }
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        if (!index.addEntry(txn, entryID, entry, options))
        {
          success = false;
        }
      }
    }
 
    return success;
  }
 
  /**
   * Update the attribute index for a deleted entry.
   *
   * @param buffer The index buffer to use to store the deleted keys
   * @param entryID     The entry ID
   * @param entry       The contents of the deleted entry.
   * @throws DatabaseException If an error occurs in the JE database.
   * @throws DirectoryException If a Directory Server error occurs.
   */
  public void removeEntry(IndexBuffer buffer, EntryID entryID, Entry entry)
       throws DatabaseException, DirectoryException
  {
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.removeEntry(buffer, entryID, entry, options);
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        index.removeEntry(buffer, entryID, entry, options);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Update the attribute index for a deleted entry.
   *
   * @param txn         The database transaction to be used for the deletions
   * @param entryID     The entry ID
   * @param entry       The contents of the deleted entry.
   * @throws DatabaseException If an error occurs in the JE database.
   * @throws DirectoryException If a Directory Server error occurs.
   */
  public void removeEntry(Transaction txn, EntryID entryID, Entry entry)
       throws DatabaseException, DirectoryException
  {
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.removeEntry(txn, entryID, entry, options);
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        index.removeEntry(txn, entryID, entry, options);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Update the index to reflect a sequence of modifications in a Modify
   * operation.
   *
   * @param txn The JE transaction to use for database updates.
   * @param entryID The ID of the entry that was modified.
   * @param oldEntry The entry before the modifications were applied.
   * @param newEntry The entry after the modifications were applied.
   * @param mods The sequence of modifications in the Modify operation.
   * @throws DatabaseException If an error occurs during an operation on a
   * JE database.
   */
  public void modifyEntry(Transaction txn,
                          EntryID entryID,
                          Entry oldEntry,
                          Entry newEntry,
                          List<Modification> mods)
       throws DatabaseException
  {
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.modifyEntry(txn, entryID, oldEntry, newEntry, mods, options);
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        index.modifyEntry(txn, entryID, oldEntry, newEntry, mods, options);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Update the index to reflect a sequence of modifications in a Modify
   * operation.
   *
   * @param buffer The index buffer used to buffer up the index changes.
   * @param entryID The ID of the entry that was modified.
   * @param oldEntry The entry before the modifications were applied.
   * @param newEntry The entry after the modifications were applied.
   * @param mods The sequence of modifications in the Modify operation.
   * @throws DatabaseException If an error occurs during an operation on a
   * JE database.
   */
  public void modifyEntry(IndexBuffer buffer,
                          EntryID entryID,
                          Entry oldEntry,
                          Entry newEntry,
                          List<Modification> mods)
       throws DatabaseException
  {
    final IndexingOptions options = indexQueryFactory.getIndexingOptions();
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.modifyEntry(buffer, entryID, oldEntry, newEntry, mods, options);
    }
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for (Index index : extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        index.modifyEntry(buffer, entryID, oldEntry, newEntry, mods, options);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Makes a byte array representing a substring index key for
   * one substring of a value.
   *
   * @param bytes The byte array containing the value.
   * @param pos The starting position of the substring.
   * @param len The length of the substring.
   * @return A byte array containing a substring key.
   */
  private byte[] makeSubstringKey(byte[] bytes, int pos, int len)
  {
    byte[] keyBytes = new byte[len];
    System.arraycopy(bytes, pos, keyBytes, 0, len);
    return keyBytes;
  }
 
  /**
   * Decompose an attribute value into a set of substring index keys.
   * The ID of the entry containing this value should be inserted
   * into the list of each of these keys.
   *
   * @param value A byte array containing the normalized attribute value.
   * @return A set of index keys.
   */
  Set<ByteString> substringKeys(byte[] value)
  { // FIXME replace this code with SDK's
    // AbstractSubstringMatchingRuleImpl.SubstringIndexer.createKeys()
 
    // Eliminate duplicates by putting the keys into a set.
    // Sorting the keys will ensure database record locks are acquired
    // in a consistent order and help prevent transaction deadlocks between
    // concurrent writers.
    Set<ByteString> set = new HashSet<ByteString>();
 
    int substrLength = indexConfig.getSubstringLength();
 
    // Example: The value is ABCDE and the substring length is 3.
    // We produce the keys ABC BCD CDE DE E
    // To find values containing a short substring such as DE,
    // iterate through keys with prefix DE. To find values
    // containing a longer substring such as BCDE, read keys
    // BCD and CDE.
    for (int i = 0, remain = value.length; remain > 0; i++, remain--)
    {
      int len = Math.min(substrLength, remain);
      byte[] keyBytes = makeSubstringKey(value, i, len);
      set.add(ByteString.wrap(keyBytes));
    }
 
    return set;
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match the provided assertion.
   *
   * @param indexQuery
   *            The query used to retrieve entries.
   * @param indexName
   *            The name of index used to retrieve entries.
   * @param filter
   *          The filter on entries.
   * @param debugBuffer
   *          If not null, a diagnostic string will be written which will help
   *          determine how the indexes contributed to this search.
   * @param monitor
   *          The database environment monitor provider that will keep index
   *          filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain the filter assertion
   *         value.
   */
  private EntryIDSet evaluateIndexQuery(IndexQuery indexQuery, String indexName, SearchFilter filter,
      StringBuilder debugBuffer, DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    LocalizableMessageBuilder debugMessage = monitor.isFilterUseEnabled() ? new LocalizableMessageBuilder() : null;
    EntryIDSet results = indexQuery.evaluate(debugMessage);
 
    if (debugBuffer != null)
    {
      debugBuffer.append("[INDEX:").append(indexConfig.getAttribute().getNameOrOID())
        .append(".").append(indexName).append("]");
    }
 
    if (monitor.isFilterUseEnabled())
    {
      if (results.isDefined())
      {
        monitor.updateStats(filter, results.size());
      }
      else
      {
        monitor.updateStats(filter, debugMessage.toMessage());
      }
    }
    return results;
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match an equality filter.
   *
   * @param equalityFilter The equality filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain the filter
   *         assertion value.
   */
  public EntryIDSet evaluateEqualityFilter(SearchFilter equalityFilter, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    try {
      final MatchingRule matchRule = equalityFilter.getAttributeType().getEqualityMatchingRule();
      final IndexQuery indexQuery = matchRule.getAssertion(equalityFilter.getAssertionValue())
          .createIndexQuery(indexQueryFactory);
      return evaluateIndexQuery(indexQuery, "equality", equalityFilter, debugBuffer, monitor);
    }
    catch (DecodeException e)
    {
      logger.traceException(e);
      return new EntryIDSet();
    }
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match a presence filter.
   *
   * @param filter The presence filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain one or more
   *         values of the attribute type in the filter.
   */
  public EntryIDSet evaluatePresenceFilter(SearchFilter filter, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    final IndexQuery indexQuery = indexQueryFactory.createMatchAllQuery();
    return evaluateIndexQuery(indexQuery, "presence", filter, debugBuffer, monitor);
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match a greater-or-equal filter.
   *
   * @param filter The greater-or-equal filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain a value
   *         greater than or equal to the filter assertion value.
   */
  public EntryIDSet evaluateGreaterOrEqualFilter(SearchFilter filter, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    return evaluateOrderingFilter(filter, true, debugBuffer, monitor);
  }
 
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match a less-or-equal filter.
   *
   * @param filter The less-or-equal filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain a value
   *         less than or equal to the filter assertion value.
   */
  public EntryIDSet evaluateLessOrEqualFilter(SearchFilter filter, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    return evaluateOrderingFilter(filter, false, debugBuffer, monitor);
  }
 
  private EntryIDSet evaluateOrderingFilter(SearchFilter filter, boolean greater, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    try {
      final MatchingRule matchRule = filter.getAttributeType().getOrderingMatchingRule();
      final Assertion assertion = greater ?
          matchRule.getGreaterOrEqualAssertion(filter.getAssertionValue()) :
          matchRule.getLessOrEqualAssertion(filter.getAssertionValue());
      final IndexQuery indexQuery = assertion.createIndexQuery(indexQueryFactory);
      return evaluateIndexQuery(indexQuery, "ordering", filter, debugBuffer, monitor);
    }
    catch (DecodeException e)
    {
      logger.traceException(e);
      return new EntryIDSet();
    }
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match a substring filter.
   *
   * @param filter The substring filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain a value
   *         that matches the filter substrings.
   */
  public EntryIDSet evaluateSubstringFilter(SearchFilter filter,
                                            StringBuilder debugBuffer,
                                            DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    try {
      final MatchingRule matchRule = filter.getAttributeType().getSubstringMatchingRule();
      final IndexQuery indexQuery = matchRule.getSubstringAssertion(
          filter.getSubInitialElement(), filter.getSubAnyElements(), filter.getSubFinalElement())
          .createIndexQuery(indexQueryFactory);
      return evaluateIndexQuery(indexQuery, "substring", filter, debugBuffer, monitor);
    }
    catch (DecodeException e)
    {
      logger.traceException(e);
      return new EntryIDSet();
    }
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match two filters that restrict a value
   * to both a lower bound and an upper bound.
   *
   * @param filter1
   *          The first filter, that is either a less-or-equal filter or a
   *          greater-or-equal filter.
   * @param filter2
   *          The second filter, that is either a less-or-equal filter or a
   *          greater-or-equal filter. It must not be of the same type than the
   *          first filter.
   * @param debugBuffer
   *          If not null, a diagnostic string will be written which will help
   *          determine how the indexes contributed to this search.
   * @param monitor
   *          The database environment monitor provider that will keep index
   *          filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain match both filters.
   */
  public EntryIDSet evaluateBoundedRange(SearchFilter filter1, SearchFilter filter2, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    // TODO : this implementation is not optimal
    // as it implies two separate evaluations instead of a single one,
    // thus defeating the purpose of the optimisation done
    // in IndexFilter#evaluateLogicalAndFilter method.
    // One solution could be to implement a boundedRangeAssertion that combine
    // the two operations in one.
    EntryIDSet results = filter1.getFilterType() == FilterType.LESS_OR_EQUAL ?
        evaluateLessOrEqualFilter(filter1, debugBuffer, monitor) :
        evaluateGreaterOrEqualFilter(filter1, debugBuffer, monitor);
    EntryIDSet results2 = filter2.getFilterType() == FilterType.LESS_OR_EQUAL ?
        evaluateLessOrEqualFilter(filter2, debugBuffer, monitor) :
        evaluateGreaterOrEqualFilter(filter2, debugBuffer, monitor);
    results.retainAll(results2);
    return results;
  }
 
  /**
   * The default lexicographic byte array comparator.
   * Is there one available in the Java platform?
   */
  public static class KeyComparator implements Comparator<byte[]>
  {
    /**
     * Compares its two arguments for order.  Returns a negative integer,
     * zero, or a positive integer as the first argument is less than, equal
     * to, or greater than the second.
     *
     * @param a the first object to be compared.
     * @param b the second object to be compared.
     * @return a negative integer, zero, or a positive integer as the
     *         first argument is less than, equal to, or greater than the
     *         second.
     */
    @Override
    public int compare(byte[] a, byte[] b)
    {
      int i;
      for (i = 0; i < a.length && i < b.length; i++)
      {
        if (a[i] > b[i])
        {
          return 1;
        }
        else if (a[i] < b[i])
        {
          return -1;
        }
      }
      if (a.length == b.length)
      {
        return 0;
      }
      if (a.length > b.length)
      {
        return 1;
      }
      return -1;
    }
  }
 
  /**
   * Byte string key comparator. The default lexicographic byte string
   * comparator.
   * <p>
   * This is the byte string equivalent of {@link KeyComparator}.
   * <p>
   * Note: Matt reckons we could simply use ByteString.compareTo(),
   * but I am using this for now as an intermediate step.
   */
  public static class BSKeyComparator implements Comparator<ByteString>
  {
    /**
     * Compares its two arguments for order. Returns a negative integer, zero,
     * or a positive integer as the first argument is less than, equal to, or
     * greater than the second.
     *
     * @param a
     *          the first object to be compared.
     * @param b
     *          the second object to be compared.
     * @return a negative integer, zero, or a positive integer as the first
     *         argument is less than, equal to, or greater than the second.
     */
    @Override
    public int compare(ByteString a, ByteString b)
    {
      int i;
      for (i = 0; i < a.length() && i < b.length(); i++)
      {
        if (a.byteAt(i) > b.byteAt(i))
        {
          return 1;
        }
        else if (a.byteAt(i) < b.byteAt(i))
        {
          return -1;
        }
      }
      if (a.length() == b.length())
      {
        return 0;
      }
      if (a.length() > b.length())
      {
        return 1;
      }
      return -1;
    }
  }
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match an approximate filter.
   *
   * @param approximateFilter The approximate filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain the filter
   *         assertion value.
   */
  public EntryIDSet evaluateApproximateFilter(SearchFilter approximateFilter, StringBuilder debugBuffer,
      DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    try {
      MatchingRule matchRule = approximateFilter.getAttributeType().getApproximateMatchingRule();
      IndexQuery indexQuery = matchRule.getAssertion(approximateFilter.getAssertionValue())
          .createIndexQuery(indexQueryFactory);
      return evaluateIndexQuery(indexQuery, "approximate", approximateFilter, debugBuffer, monitor);
    }
    catch (DecodeException e)
    {
      logger.traceException(e);
      return new EntryIDSet();
    }
  }
 
  /**
   * Close cursors related to the attribute indexes.
   *
   * @throws DatabaseException If a database error occurs.
   */
  public void closeCursors() throws DatabaseException {
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.closeCursor();
    }
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        extensibleIndex.closeCursor();
      }
    }
  }
 
  /**
   * Return the number of values that have exceeded the entry limit since this
   * object was created.
   *
   * @return The number of values that have exceeded the entry limit.
   */
  public long getEntryLimitExceededCount()
  {
    long entryLimitExceededCount = 0;
 
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      entryLimitExceededCount += index.getEntryLimitExceededCount();
    }
 
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        entryLimitExceededCount += extensibleIndex.getEntryLimitExceededCount();
      }
    }
    return entryLimitExceededCount;
  }
 
  /**
   * Get a list of the databases opened by this attribute index.
   * @param dbList A list of database containers.
   */
  public void listDatabases(List<DatabaseContainer> dbList)
  {
    dbList.addAll(nameToIndexes.values());
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      dbList.addAll(extensibleIndexes.getIndexes());
    }
  }
 
  /**
   * Get a string representation of this object.
   * @return return A string representation of this object.
   */
  @Override
  public String toString()
  {
    return getName();
  }
 
  /** {@inheritDoc} */
  @Override
  public synchronized boolean isConfigurationChangeAcceptable(
      LocalDBIndexCfg cfg, List<LocalizableMessage> unacceptableReasons)
  {
    AttributeType attrType = cfg.getAttribute();
 
    if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.EQUALITY)
        && nameToIndexes.get(IndexType.EQUALITY.toString()) == null
        && attrType.getEqualityMatchingRule() == null)
    {
      unacceptableReasons.add(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "equality"));
      return false;
    }
    if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.SUBSTRING)
        && nameToIndexes.get(IndexType.SUBSTRING.toString()) == null
        && attrType.getSubstringMatchingRule() == null)
    {
      unacceptableReasons.add(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "substring"));
      return false;
    }
    if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.ORDERING)
        && nameToIndexes.get(IndexType.ORDERING.toString()) == null
        && attrType.getOrderingMatchingRule() == null)
    {
      unacceptableReasons.add(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "ordering"));
      return false;
    }
    if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.APPROXIMATE)
        && nameToIndexes.get(IndexType.APPROXIMATE.toString()) == null
        && attrType.getApproximateMatchingRule() == null)
    {
      unacceptableReasons.add(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "approximate"));
      return false;
    }
    if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.EXTENSIBLE))
    {
      Set<String> newRules = cfg.getIndexExtensibleMatchingRule();
      if (newRules == null || newRules.isEmpty())
      {
        unacceptableReasons.add(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_MATCHING_RULE.get(attrType, "extensible"));
        return false;
      }
    }
 
    return true;
  }
 
  /** {@inheritDoc} */
  @Override
  public synchronized ConfigChangeResult applyConfigurationChange(
      LocalDBIndexCfg cfg)
  {
    // this method is not perf sensitive, using an AtomicBoolean will not hurt
    AtomicBoolean adminActionRequired = new AtomicBoolean(false);
    ArrayList<LocalizableMessage> messages = new ArrayList<LocalizableMessage>();
    try
    {
      AttributeType attrType = cfg.getAttribute();
      String name = entryContainer.getDatabasePrefix() + "_" + attrType.getNameOrOID();
      final int indexEntryLimit = cfg.getIndexEntryLimit();
      final JEIndexConfig config = new JEIndexConfig(cfg.getSubstringLength());
 
      Index presenceIndex = nameToIndexes.get(IndexType.PRESENCE.toString());
      if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.PRESENCE))
      {
        if(presenceIndex == null)
        {
          Indexer presenceIndexer = new PresenceIndexer(attrType);
          presenceIndex = newIndex(name + ".presence", indexEntryLimit, presenceIndexer);
          openIndex(presenceIndex, adminActionRequired, messages);
          nameToIndexes.put(IndexType.PRESENCE.toString(), presenceIndex);
        }
        else
        {
          // already exists. Just update index entry limit.
          if(presenceIndex.setIndexEntryLimit(indexEntryLimit))
          {
            adminActionRequired.set(true);
            messages.add(NOTE_JEB_CONFIG_INDEX_ENTRY_LIMIT_REQUIRES_REBUILD.get(presenceIndex.getName()));
          }
        }
      }
      else
      {
        removeIndex(presenceIndex, IndexType.PRESENCE);
      }
 
      applyChangeToIndex(cfg, attrType, name, IndexType.EQUALITY,
          new EqualityIndexer(attrType), adminActionRequired, messages);
      applyChangeToIndex(cfg, attrType, name, IndexType.SUBSTRING,
          new SubstringIndexer(attrType), adminActionRequired, messages);
      applyChangeToIndex(cfg, attrType, name, IndexType.ORDERING,
          new OrderingIndexer(attrType), adminActionRequired, messages);
      applyChangeToIndex(cfg, attrType, name, IndexType.APPROXIMATE,
          new ApproximateIndexer(attrType), adminActionRequired, messages);
 
      if (cfg.getIndexType().contains(IndexType.EXTENSIBLE))
      {
        Set<String> extensibleRules = cfg.getIndexExtensibleMatchingRule();
        Set<ExtensibleMatchingRule> validRules = new HashSet<ExtensibleMatchingRule>();
        if(extensibleIndexes == null)
        {
          extensibleIndexes = new ExtensibleMatchingRuleIndex();
        }
        for(String ruleName:extensibleRules)
        {
          ExtensibleMatchingRule rule = DirectoryServer.getExtensibleMatchingRule(toLowerCase(ruleName));
          if(rule == null)
          {
            logger.error(ERR_CONFIG_INDEX_TYPE_NEEDS_VALID_MATCHING_RULE, attrType, ruleName);
            continue;
          }
          validRules.add(rule);
          Map<String,Index> indexMap = new HashMap<String,Index>();
          for (ExtensibleIndexer indexer : rule.getIndexers())
          {
            String indexID = attrType.getNameOrOID() + "." + indexer.getIndexID();
            if(!extensibleIndexes.isIndexPresent(indexID))
            {
              String indexName =  entryContainer.getDatabasePrefix() + "_" + indexID;
              Index extIndex = newExtensibleIndex(indexName, attrType, indexEntryLimit, indexer);
              extensibleIndexes.addIndex(extIndex,indexID);
              openIndex(extIndex, adminActionRequired, messages);
            }
            else
            {
              Index extensibleIndex = extensibleIndexes.getIndex(indexID);
              if(extensibleIndex.setIndexEntryLimit(indexEntryLimit))
              {
                adminActionRequired.set(true);
                messages.add(NOTE_JEB_CONFIG_INDEX_ENTRY_LIMIT_REQUIRES_REBUILD.get(extensibleIndex.getName()));
              }
              if (indexConfig.getSubstringLength() != cfg.getSubstringLength())
              {
                extensibleIndex.setIndexer(
                    new JEExtensibleIndexer(attrType, indexer));
              }
            }
            extensibleIndexes.addRule(indexID, rule);
            indexMap.put(indexer.getExtensibleIndexID(), extensibleIndexes.getIndex(indexID));
          }
          IndexQueryFactory<IndexQuery> factory = new IndexQueryFactoryImpl(indexMap, config);
          extensibleIndexes.addQueryFactory(rule, factory);
        }
        //Some rules might have been removed from the configuration.
        Set<ExtensibleMatchingRule> deletedRules =
            new HashSet<ExtensibleMatchingRule>(extensibleIndexes.getRules());
        deletedRules.removeAll(validRules);
        if(deletedRules.size() > 0)
        {
          entryContainer.exclusiveLock.lock();
          try
          {
            for(ExtensibleMatchingRule rule:deletedRules)
            {
              Set<ExtensibleMatchingRule> rules = new HashSet<ExtensibleMatchingRule>();
              List<String> ids = new ArrayList<String>();
              for (ExtensibleIndexer indexer : rule.getIndexers())
              {
                String id = attrType.getNameOrOID()  + "." + indexer.getIndexID();
                ids.add(id);
                rules.addAll(extensibleIndexes.getRules(id));
              }
              if(rules.isEmpty())
              {
                //Rule has been already deleted.
                continue;
              }
              //If all the rules are part of the deletedRules, delete this index
              if(deletedRules.containsAll(rules))
              {
                //it is safe to delete this index as it is not shared.
                for(String indexID : ids)
                {
                  Index extensibleIndex = extensibleIndexes.getIndex(indexID);
                  entryContainer.deleteDatabase(extensibleIndex);
                  extensibleIndexes.deleteIndex(indexID);
                  extensibleIndexes.deleteRule(indexID);
                }
              }
              else
              {
                for(String indexID : ids)
                {
                  extensibleIndexes.deleteRule(rule, indexID);
                }
              }
            }
          }
          finally
          {
            entryContainer.exclusiveLock.unlock();
          }
        }
      }
      else
      {
        if(extensibleIndexes != null)
        {
          entryContainer.exclusiveLock.lock();
          try
          {
            for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
            {
              entryContainer.deleteDatabase(extensibleIndex);
            }
            extensibleIndexes.deleteAll();
          }
          finally
          {
            entryContainer.exclusiveLock.unlock();
          }
        }
      }
 
      indexConfig = cfg;
 
      return new ConfigChangeResult(ResultCode.SUCCESS, adminActionRequired.get(), messages);
    }
    catch(Exception e)
    {
      messages.add(LocalizableMessage.raw(StaticUtils.stackTraceToSingleLineString(e)));
      return new ConfigChangeResult(
          DirectoryServer.getServerErrorResultCode(), adminActionRequired.get(), messages);
    }
  }
 
  private void applyChangeToIndex(LocalDBIndexCfg cfg, AttributeType attrType,
      String name, IndexType indexType, ExtensibleIndexer indexer,
      AtomicBoolean adminActionRequired, ArrayList<LocalizableMessage> messages)
  {
    final int indexEntryLimit = cfg.getIndexEntryLimit();
 
    Index index = nameToIndexes.get(indexType.toString());
    if (cfg.getIndexType().contains(indexType))
    {
      if (index == null)
      {
        index = openNewIndex(name, attrType, indexEntryLimit,
            indexer, adminActionRequired, messages);
        nameToIndexes.put(indexType.toString(), index);
      }
      else
      {
        // already exists. Just update index entry limit.
        if(index.setIndexEntryLimit(indexEntryLimit))
        {
          adminActionRequired.set(true);
          messages.add(NOTE_JEB_CONFIG_INDEX_ENTRY_LIMIT_REQUIRES_REBUILD.get(index.getName()));
        }
      }
    }
    else
    {
      removeIndex(index, indexType);
    }
  }
 
  private void removeIndex(Index index, IndexType indexType)
  {
    if (index != null)
    {
      entryContainer.exclusiveLock.lock();
      try
      {
        nameToIndexes.remove(indexType.toString());
        entryContainer.deleteDatabase(index);
      }
      finally
      {
        entryContainer.exclusiveLock.unlock();
      }
    }
  }
 
  private Index openNewIndex(String name, AttributeType attrType,
      int indexEntryLimit, ExtensibleIndexer indexer,
      AtomicBoolean adminActionRequired, ArrayList<LocalizableMessage> messages)
  {
    final String indexName = name + "." + indexer.getExtensibleIndexID();
    Index index = newExtensibleIndex(indexName, attrType, indexEntryLimit, indexer);
    return openIndex(index, adminActionRequired, messages);
  }
 
  private Index openIndex(Index index, AtomicBoolean adminActionRequired,
      ArrayList<LocalizableMessage> messages)
  {
    index.open();
 
    if (!index.isTrusted())
    {
      adminActionRequired.set(true);
      messages.add(NOTE_JEB_INDEX_ADD_REQUIRES_REBUILD.get(index.getName()));
    }
    return index;
  }
 
  /**
   * Set the index truststate.
   * @param txn A database transaction, or null if none is required.
   * @param trusted True if this index should be trusted or false
   *                otherwise.
   * @throws DatabaseException If an error occurs in the JE database.
   */
  public synchronized void setTrusted(Transaction txn, boolean trusted)
      throws DatabaseException
  {
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.setTrusted(txn, trusted);
    }
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        extensibleIndex.setTrusted(txn, trusted);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Return true iff this index is trusted.
   * @return the trusted state of this index
   */
  public boolean isTrusted()
  {
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      if (!index.isTrusted())
      {
        return false;
      }
    }
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        if (!extensibleIndex.isTrusted())
        {
          return false;
        }
      }
    }
 
    return true;
  }
 
  /**
   * Set the rebuild status of this index.
   * @param rebuildRunning True if a rebuild process on this index
   *                       is running or False otherwise.
   */
  public synchronized void setRebuildStatus(boolean rebuildRunning)
  {
    for (Index index : nameToIndexes.values())
    {
      index.setRebuildStatus(rebuildRunning);
    }
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      for(Index extensibleIndex:extensibleIndexes.getIndexes())
      {
        extensibleIndex.setRebuildStatus(rebuildRunning);
      }
    }
  }
 
  /**
   * Get the JE database name prefix for indexes in this attribute index.
   *
   * @return JE database name for this database container.
   */
  public String getName()
  {
    return entryContainer.getDatabasePrefix()
        + "_"
        + indexConfig.getAttribute().getNameOrOID();
  }
 
  /**
   * Return the equality index.
   *
   * @return The equality index.
   */
  public Index getEqualityIndex() {
    return nameToIndexes.get(IndexType.EQUALITY.toString());
  }
 
  /**
   * Return the approximate index.
   *
   * @return The approximate index.
   */
  public Index getApproximateIndex() {
    return nameToIndexes.get(IndexType.APPROXIMATE.toString());
  }
 
  /**
   * Return the ordering index.
   *
   * @return  The ordering index.
   */
  public Index getOrderingIndex() {
    return nameToIndexes.get(IndexType.ORDERING.toString());
  }
 
  /**
   * Return the substring index.
   *
   * @return The substring index.
   */
  public Index getSubstringIndex() {
    return nameToIndexes.get(IndexType.SUBSTRING.toString());
  }
 
  /**
   * Return the presence index.
   *
   * @return The presence index.
   */
  public Index getPresenceIndex() {
    return nameToIndexes.get(IndexType.PRESENCE.toString());
  }
 
  /**
   * Return the mapping of  extensible index types and indexes.
   *
   * @return The Map of extensible index types and indexes.
   */
  public Map<String,Collection<Index>> getExtensibleIndexes()
  {
    if (extensibleIndexes != null)
    {
      return extensibleIndexes.getIndexMap();
    }
    return Collections.emptyMap();
  }
 
 
  /**
   * Retrieves all the indexes used by this attribute index.
   *
   * @return A collection of all indexes in use by this attribute
   * index.
   */
  public Collection<Index> getAllIndexes() {
    LinkedHashSet<Index> indexes = new LinkedHashSet<Index>();
    indexes.addAll(nameToIndexes.values());
 
    if(extensibleIndexes!=null)
    {
      indexes.addAll(extensibleIndexes.getIndexes());
    }
    return indexes;
  }
 
 
  /**
   * Retrieve the entry IDs that might match an extensible filter.
   *
   * @param filter The extensible filter.
   * @param debugBuffer If not null, a diagnostic string will be written
   *                     which will help determine how the indexes contributed
   *                     to this search.
   * @param monitor The database environment monitor provider that will keep
   *                index filter usage statistics.
   * @return The candidate entry IDs that might contain the filter
   *         assertion value.
   */
  public EntryIDSet evaluateExtensibleFilter(SearchFilter filter,
                                             StringBuilder debugBuffer,
                                             DatabaseEnvironmentMonitor monitor)
  {
    //Get the Matching Rule OID of the filter.
    String matchRuleOID  = filter.getMatchingRuleID();
    /**
     * Use the default equality index in two conditions:
     * 1. There is no matching rule provided
     * 2. The matching rule specified is actually the default equality.
     */
    MatchingRule eqRule = indexConfig.getAttribute().getEqualityMatchingRule();
    if (matchRuleOID == null
        || matchRuleOID.equals(eqRule.getOID())
        || matchRuleOID.equalsIgnoreCase(eqRule.getNameOrOID()))
    {
      //No matching rule is defined; use the default equality matching rule.
      return evaluateEqualityFilter(filter, debugBuffer, monitor);
    }
 
    ExtensibleMatchingRule rule = DirectoryServer.getExtensibleMatchingRule(matchRuleOID);
    IndexQueryFactory<IndexQuery> factory = null;
    if (extensibleIndexes == null || (factory = extensibleIndexes.getQueryFactory(rule)) == null)
    {
      // There is no index on this matching rule.
      if (monitor.isFilterUseEnabled())
      {
        monitor.updateStats(filter, INFO_JEB_INDEX_FILTER_MATCHING_RULE_NOT_INDEXED.get(
            matchRuleOID, indexConfig.getAttribute().getNameOrOID()));
      }
      return IndexQuery.createNullIndexQuery().evaluate(null);
    }
 
    try
    {
      if (debugBuffer != null)
      {
        debugBuffer.append("[INDEX:");
        for (ExtensibleIndexer indexer : rule.getIndexers())
        {
          debugBuffer.append(" ")
                     .append(filter.getAttributeType().getNameOrOID())
                     .append(".")
                     .append(indexer.getIndexID());
        }
        debugBuffer.append("]");
      }
      ByteString assertionValue = filter.getAssertionValue();
      IndexQuery indexQuery = rule.createIndexQuery(assertionValue, factory);
      LocalizableMessageBuilder debugMessage = monitor.isFilterUseEnabled() ? new LocalizableMessageBuilder() : null;
      EntryIDSet results = indexQuery.evaluate(debugMessage);
      if (monitor.isFilterUseEnabled())
      {
        if (results.isDefined())
        {
          monitor.updateStats(filter, results.size());
        }
        else
        {
          monitor.updateStats(filter, debugMessage.toMessage());
        }
      }
      return results;
    }
    catch (DecodeException e)
    {
      logger.traceException(e);
      return IndexQuery.createNullIndexQuery().evaluate(null);
    }
  }
 
  /**
   * This class manages all the configured extensible matching rules and
   * their corresponding indexes.
   */
  private static class ExtensibleMatchingRuleIndex
  {
    /**
      * The mapping of index ID and Index database.
      */
    private final Map<String,Index> id2IndexMap;
 
    /**
     * The mapping of Index ID and Set the matching rules.
     */
    private final Map<String,Set<ExtensibleMatchingRule>> id2RulesMap;
 
    /**
     * The Map of configured ExtensibleMatchingRule and the corresponding
     * IndexQueryFactory.
     */
    private final Map<ExtensibleMatchingRule,
            IndexQueryFactory<IndexQuery>> rule2FactoryMap;
 
    /**
     * Creates a new instance of ExtensibleMatchingRuleIndex.
     */
    private ExtensibleMatchingRuleIndex()
    {
      id2IndexMap = new HashMap<String,Index>();
      id2RulesMap = new HashMap<String,Set<ExtensibleMatchingRule>>();
      rule2FactoryMap = new HashMap<ExtensibleMatchingRule,
              IndexQueryFactory<IndexQuery>>();
    }
 
    /**
     * Returns all configured ExtensibleMatchingRule instances.
     * @return A Set  of extensible matching rules.
     */
    private Set<ExtensibleMatchingRule> getRules()
    {
      return rule2FactoryMap.keySet();
    }
 
    /**
     * Returns  ExtensibleMatchingRule instances for an index.
     * @param indexID The index ID of an extensible matching rule index.
     * @return A Set of extensible matching rules corresponding to
     *                 an index ID.
     */
    private Set<ExtensibleMatchingRule> getRules(String indexID)
    {
      Set<ExtensibleMatchingRule> rules = id2RulesMap.get(indexID);
      if (rules != null)
      {
        return Collections.unmodifiableSet(rules);
      }
      return Collections.emptySet();
    }
 
    /**
     * Returns whether an index is present or not.
     * @param indexID The index ID of an extensible matching rule index.
     * @return True if an index is present. False if there is no matching index.
     */
    private boolean isIndexPresent(String indexID)
    {
      return id2IndexMap.containsKey(indexID);
    }
 
 
    /**
     * Returns the index corresponding to an index ID.
     * @param indexID The ID of an index.
     * @return The extensible rule index corresponding to the index ID.
     */
    private Index getIndex(String indexID)
    {
      return id2IndexMap.get(indexID);
    }
 
 
    /**
     * Adds a new matching Rule and the name of the associated index.
     * @indexName Name of the index.
     * @rule An ExtensibleMatchingRule instance that needs to be indexed.
     */
    private void addRule(String indexName,ExtensibleMatchingRule rule)
    {
      Set<ExtensibleMatchingRule> rules = id2RulesMap.get(indexName);
      if(rules == null)
      {
        rules = new HashSet<ExtensibleMatchingRule>();
        id2RulesMap.put(indexName, rules);
      }
      rules.add(rule);
    }
 
    /**
     * Adds a new Index and its name.
     * @param index The extensible matching rule index.
     * @indexName The name of the index.
     */
    private void addIndex(Index index,String indexName)
    {
      id2IndexMap.put(indexName, index);
    }
 
    /**
     * Returns all the configured extensible indexes.
     * @return All the available extensible matching rule indexes.
     */
    private Collection<Index> getIndexes()
    {
      return Collections.unmodifiableCollection(id2IndexMap.values());
    }
 
 
    /**
     * Returns a map of all the configured extensible indexes and their types.
     * @return A map of all the available extensible matching rule indexes
     *             and their types.
     */
    private Map<String,Collection<Index>> getIndexMap()
    {
      if(id2IndexMap.isEmpty())
      {
        return Collections.emptyMap();
      }
      Collection<Index> substring = new ArrayList<Index>();
      Collection<Index> shared = new ArrayList<Index>();
      for(Map.Entry<String,Index> entry :  id2IndexMap.entrySet())
      {
        String indexID = entry.getKey();
        if(indexID.endsWith(EXTENSIBLE_INDEXER_ID_SUBSTRING))
        {
          substring.add(entry.getValue());
        }
        else
        {
          shared.add(entry.getValue());
        }
      }
      Map<String,Collection<Index>> indexMap =
              new HashMap<String,Collection<Index>>();
      indexMap.put(EXTENSIBLE_INDEXER_ID_SUBSTRING, substring);
      indexMap.put(EXTENSIBLE_INDEXER_ID_SHARED, shared);
      return Collections.unmodifiableMap(indexMap);
    }
 
 
    /**
     * Deletes an index corresponding to the index ID.
     * @param indexID Name of the index.
     */
    private void deleteIndex(String indexID)
    {
      id2IndexMap.remove(indexID);
    }
 
 
    /**
     * Deletes an extensible matching rule from the list of available rules.
     * @param rule The ExtensibleMatchingRule that needs to be removed.
     * @param indexID The name of the index corresponding to the rule.
     */
    private void deleteRule(ExtensibleMatchingRule rule,String indexID)
    {
      Set<ExtensibleMatchingRule> rules = id2RulesMap.get(indexID);
      rules.remove(rule);
      if(rules.isEmpty())
      {
        id2RulesMap.remove(indexID);
      }
      rule2FactoryMap.remove(rule);
    }
 
 
    /**
     * Adds an ExtensibleMatchingRule and its corresponding IndexQueryFactory.
     * @param rule An ExtensibleMatchingRule that needs to be added.
     * @param query A query factory matching the rule.
     */
    private void addQueryFactory(ExtensibleMatchingRule rule,
            IndexQueryFactory<IndexQuery> query)
    {
      rule2FactoryMap.put(rule, query);
    }
 
 
    /**
     * Returns the query factory associated with the rule.
     * @param rule An ExtensibleMatchingRule that needs to be searched.
     * @return An IndexQueryFactory corresponding to the matching rule.
     */
    private IndexQueryFactory<IndexQuery> getQueryFactory(
            ExtensibleMatchingRule rule)
    {
      return rule2FactoryMap.get(rule);
    }
 
 
    /**
     * Deletes  extensible matching rules from the list of available rules.
     * @param indexID The name of the index corresponding to the rules.
     */
    private void deleteRule(String indexID)
    {
      Set<ExtensibleMatchingRule> rules  = id2RulesMap.get(indexID);
      for (ExtensibleMatchingRule rule : rules)
      {
        rule2FactoryMap.remove(rule);
      }
      rules.clear();
      id2RulesMap.remove(indexID);
    }
 
 
    /**
     * Deletes all references to matching rules and the indexes.
     */
    private void deleteAll()
    {
      id2IndexMap.clear();
      id2RulesMap.clear();
      rule2FactoryMap.clear();
    }
  }
 
  /**
   * This class extends the IndexConfig for JE Backend.
   */
  private class JEIndexConfig implements IndexingOptions
  {
    /** The length of the substring index. */
    private int substringLength;
 
    /**
     * Creates a new JEIndexConfig instance.
     * @param substringLength The length of the substring.
     */
    private JEIndexConfig(int substringLength)
    {
      this.substringLength = substringLength;
    }
 
    /** {@inheritDoc} */
    @Override
    public int substringKeySize()
    {
      return substringLength;
    }
  }
}