OPENDJ-1849 CR-6871 Remove references to JE from pluggable backend

Fabio Pistolesi

06.40.2015 b52956de75caa2be959a4bdc768462070aa6549f

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/server/backends/pluggable/VerifyJob.java

@@ -98,16 +98,16 @@
  private IdentityHashMap<Index, HashMap<ByteString, Long>> entryLimitMap =
       new IdentityHashMap<Index, HashMap<ByteString, Long>>();

  /** Indicates whether the DN database is to be verified. */
  /** Indicates whether dn2id is to be verified. */
  private boolean verifyDN2ID;
  /** Indicates whether the children count database is to be verified. */
  /** Indicates whether the children count tree is to be verified. */
  private boolean verifyID2ChildrenCount;

  /** The entry database. */
  /** The entry tree. */
  private ID2Entry id2entry;
  /** The DN database. */
  /** The DN tree. */
  private DN2ID dn2id;
  /** The children database. */
  /** The children tree. */
  private ID2Count id2childrenCount;

  /** A list of the attribute indexes to be verified. */
@@ -131,7 +131,7 @@
   *
   * @param rootContainer The root container that holds the entries to verify.
   * @return The error count.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   * @throws DirectoryException If an error occurs while verifying the backend.
   */
  long verifyBackend() throws StorageRuntimeException,
@@ -347,7 +347,7 @@
   * index completeness. We check that the ID for the entry is indeed
   * present in the indexes for the appropriate values.
   *
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   */
  private void iterateID2Entry(ReadableTransaction txn) throws StorageRuntimeException
  {
@@ -415,7 +415,7 @@
   * index cleanliness. For each ID in the index we check that the
   * entry it refers to does indeed contain the expected value.
   *
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   * @throws DirectoryException If an error occurs reading values in the index.
   */
  private void iterateIndex(ReadableTransaction txn) throws StorageRuntimeException, DirectoryException
@@ -447,7 +447,7 @@
   * Iterate through the entries in DN2ID to perform a check for
   * index cleanliness.
   *
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   */
  private void iterateDN2ID(ReadableTransaction txn) throws StorageRuntimeException
  {
@@ -612,7 +612,7 @@
   *
   * @param vlvIndex The VLV index to perform the check against.
   * @param verifyID True to verify the IDs against id2entry.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   * @throws DirectoryException If an error occurs reading values in the index.
   */
  private void iterateVLVIndex(ReadableTransaction txn, VLVIndex vlvIndex, boolean verifyID)
@@ -669,8 +669,8 @@
  /**
   * Iterate through the entries in an attribute index to perform a check for
   * index cleanliness.
   * @param index The index database to be checked.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the database.
   * @param index The index tree to be checked.
   * @throws StorageRuntimeException If an error occurs in the storage.
   */
  private void iterateAttrIndex(ReadableTransaction txn, MatchingRuleIndex index, IndexingOptions options)
      throws StorageRuntimeException
@@ -885,7 +885,7 @@
   * Construct a printable string from a raw key value.
   *
   * @param indexName
   *          The name of the index database containing the key value.
   *          The name of the index tree containing the key value.
   * @param key
   *          The bytes of the key.
   * @return A string that may be logged or printed.
@@ -995,7 +995,7 @@
      {
        logger.traceException(e);

        logger.trace("Error reading database: %s%n%s", e.getMessage(), keyDump(index.toString(), key));
        logger.trace("Error reading tree: %s%n%s", e.getMessage(), keyDump(index.toString(), key));
      }
      errorCount++;
    }
@@ -1065,8 +1065,7 @@
     * Create a new verify progress task.
     * @param indexIterator boolean, indicates if the task is iterating
     * through indexes or the entries.
     * @throws StorageRuntimeException An error occurred while accessing the JE
     * database.
     * @throws StorageRuntimeException An error occurred while accessing the storage.
     */
    private ProgressTask(boolean indexIterator, ReadableTransaction txn) throws StorageRuntimeException
    {