Fix CodeQL note-severity alerts: Thread.run() calls and getters leaking int...

Valery Kharseko

6 hours ago 7af51501d5a70e6cdff45d7c1c804f0e820d1d3a

Fix CodeQL note-severity alerts: Thread.run() calls and getters leaking internal state (#847)

 opendj-cli/src/main/java/com/forgerock/opendj/cli/Argument.java

@@ -13,6 +13,7 @@
 *
 * Copyright 2006-2008 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions copyright 2014-2016 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package com.forgerock.opendj.cli;

@@ -374,6 +375,9 @@

    /**
     * Retrieves the set of string values for this argument.
     * <p>
     * The returned list is the live one: {@code ListBackends} removes the backend identifiers it
     * could not resolve from it, and {@code InstallDS} adds the default base DN to it.
     *
     * @return The set of string values for this argument.
     */

 opendj-cli/src/main/java/com/forgerock/opendj/cli/ArgumentParser.java

@@ -582,10 +582,20 @@
     * Retrieves the set of unnamed trailing arguments that were provided on the
     * command line.
     *
     * @return The set of unnamed trailing arguments that were provided on the
     * @return A copy of the set of unnamed trailing arguments that were provided on the
     *         command line.
     */
    public ArrayList<String> getTrailingArguments() {
        return new ArrayList<>(trailingArguments);
    }

    /**
     * Returns the live list of unnamed trailing arguments, so that a sub-class parsing the
     * command line can fill it in. Unlike {@link #getTrailingArguments()}, this does not copy.
     *
     * @return The list of unnamed trailing arguments held by this parser.
     */
    List<String> trailingArguments() {
        return trailingArguments;
    }


 opendj-cli/src/main/java/com/forgerock/opendj/cli/FileBasedArgument.java

@@ -13,6 +13,7 @@
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 */
package com.forgerock.opendj.cli;

@@ -105,6 +106,9 @@
    /**
     * Retrieves a map between the filenames specified on the command line and
     * the first lines read from those files.
     * <p>
     * The returned map is the live one: the tools building an equivalent command line add
     * entries to it, so that a password read interactively is displayed as a password file.
     *
     * @return A map between the filenames specified on the command line and the
     *         first lines read from those files.

 opendj-cli/src/main/java/com/forgerock/opendj/cli/SubCommandArgumentParser.java

@@ -318,7 +318,7 @@
    @Override
    public void parseArguments(String[] rawArguments, Properties argumentProperties) throws ArgumentException {
        this.subCommand = null;
        final ArrayList<String> trailingArguments = getTrailingArguments();
        final List<String> trailingArguments = trailingArguments();
        trailingArguments.clear();
        setUsageOrVersionDisplayed(false);


 opendj-ldap-toolkit/src/main/java/com/forgerock/opendj/ldap/tools/StatsThread.java

@@ -12,6 +12,7 @@
 * information: "Portions Copyright [year] [name of copyright owner]".
 *
 * Copyright 2016 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package com.forgerock.opendj.ldap.tools;

@@ -47,8 +48,12 @@
 * Statistics thread base implementation.
 * <p>
 * The goal of this class is to compute and print rate tool general statistics.
 * <p>
 * This class is a {@link Runnable} rather than a {@link Thread}: it is run periodically by
 * {@code statThreadScheduler}, and {@link #stopRecording(boolean)} calls {@link #run()} directly
 * to print the last line of statistics.
 */
class StatsThread extends Thread {
class StatsThread implements Runnable {

    static final String STAT_ID_PREFIX = "org.forgerock.opendj.";

@@ -263,10 +268,10 @@
    private final RateReporter reporter;
    private long startTimeMs;
    private volatile boolean warmingUp;
    private final ScheduledExecutorService statThreadScheduler = Executors.newSingleThreadScheduledExecutor();
    private final ScheduledExecutorService statThreadScheduler =
            Executors.newSingleThreadScheduledExecutor(runnable -> new Thread(runnable, "Stats Thread"));

    StatsThread(final PerformanceRunner performanceRunner, final ConsoleApplication application) {
        super("Stats Thread");
        resetStats();
        this.performanceRunner = performanceRunner;
        this.app = application;

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/guitools/controlpanel/datamodel/Category.java

@@ -13,11 +13,14 @@
 *
 * Copyright 2008 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions Copyright 2014-2015 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */

package org.opends.guitools.controlpanel.datamodel;

import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.List;

import org.forgerock.i18n.LocalizableMessage;

@@ -30,7 +33,7 @@
public class Category
{
  private LocalizableMessage name;
  private ArrayList<Action> actions = new ArrayList<>();
  private final List<Action> actions = new ArrayList<>();

  /**
   * Returns the name of the category.
@@ -52,10 +55,19 @@

  /**
   * Returns the actions associated with this category.
   * @return the actions associated with this category.
   * @return an unmodifiable view of the actions associated with this category.
   */
  public ArrayList<Action> getActions()
  public List<Action> getActions()
  {
    return actions;
    return Collections.unmodifiableList(actions);
  }

  /**
   * Adds an action to this category.
   * @param action the action to add.
   */
  public void addAction(Action action)
  {
    actions.add(action);
  }
}

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/guitools/controlpanel/ui/MainActionsPane.java

@@ -13,6 +13,7 @@
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 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */

package org.opends.guitools.controlpanel.ui;
@@ -272,7 +273,7 @@
        action.setAssociatedPanel(classes.get(classIndex));
        classIndex ++;

        category.getActions().add(action);
        category.addAction(action);
      }
      categories.add(category);
    }

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/quicksetup/installer/SuffixesToReplicateOptions.java

@@ -13,9 +13,11 @@
 *
 * Copyright 2006-2010 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions Copyright 2015 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package org.opends.quicksetup.installer;

import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.LinkedHashSet;
import java.util.Map;
@@ -46,10 +48,10 @@
    REPLICATE_WITH_EXISTING_SUFFIXES
  }

  private Type type;
  private Set<SuffixDescriptor> availableSuffixes;
  private Set<SuffixDescriptor> suffixesToReplicate;
  private Map<String, BackendTypeUIAdapter> backendsToReplicate;
  private final Type type;
  private final Set<SuffixDescriptor> availableSuffixes;
  private final Set<SuffixDescriptor> suffixesToReplicate;
  private final Map<String, BackendTypeUIAdapter> backendsToReplicate;

  /**
   * Constructor for the SuffixesToReplicateOptions object.
@@ -84,9 +86,9 @@
      Set<SuffixDescriptor> suffixesToReplicate, Map<String, BackendTypeUIAdapter> backendsToReplicate)
  {
    this.type = type;
    this.availableSuffixes = new LinkedHashSet<>(availableSuffixes);
    this.suffixesToReplicate = new LinkedHashSet<>(suffixesToReplicate);
    this.backendsToReplicate = new HashMap<>(backendsToReplicate);
    this.availableSuffixes = Collections.unmodifiableSet(new LinkedHashSet<>(availableSuffixes));
    this.suffixesToReplicate = Collections.unmodifiableSet(new LinkedHashSet<>(suffixesToReplicate));
    this.backendsToReplicate = Collections.unmodifiableMap(new HashMap<>(backendsToReplicate));
  }

  /**
@@ -103,7 +105,7 @@
  /**
   * Returns the set of suffixes available for replication.
   *
   * @return the set of suffixes available for replication.
   * @return an unmodifiable set of the suffixes available for replication.
   */
  public Set<SuffixDescriptor> getAvailableSuffixes()
  {
@@ -113,7 +115,7 @@
  /**
   * The set of suffixes that we must replicate with.
   *
   * @return the set of suffixes that we must replicate with.
   * @return an unmodifiable set of the suffixes that we must replicate with.
   */
  public Set<SuffixDescriptor> getSuffixes()
  {
@@ -123,7 +125,7 @@
  /**
   * Returns a map which associate backend names and backend types.
   *
   * @return A map which associate backend names and backend types.
   * @return an unmodifiable map which associate backend names and backend types.
   */
  public Map<String, BackendTypeUIAdapter> getSuffixBackendTypes()
  {

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/server/admin/client/cli/SecureConnectionCliArgs.java

@@ -13,6 +13,7 @@
 *
 * Copyright 2007-2010 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions Copyright 2011-2016 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package org.opends.server.admin.client.cli;

@@ -159,7 +160,9 @@
   * @throws ArgumentException
   *           If there is a problem with any of the parameters used to create
   *           this argument.
   * @return a ArrayList with the options created.
   * @return a new set holding the options created. Callers may add their own arguments to it:
   *         the set is a copy, so doing so does not add them to the connection arguments this
   *         object reports through {@link #argumentsPresent()}.
   */
  public Set<Argument> createGlobalArguments() throws ArgumentException
  {
@@ -230,7 +233,7 @@
    connectTimeoutArg = connectTimeOutArgument();
    argList.add(connectTimeoutArg);

    return argList;
    return new LinkedHashSet<>(argList);
  }

  /**

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/server/replication/service/ReplicationDomain.java

@@ -14,6 +14,7 @@
 * Copyright 2008-2010 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions Copyright 2011-2016 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2025-2026 3A Systems LLC.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package org.opends.server.replication.service;

@@ -885,11 +886,11 @@
      if (initReqMsg != null)
      {
        // Do this work in a thread to allow replay thread continue working
        ExportThread exportThread = new ExportThread(
        ExportTask exportTask = new ExportTask(
            initReqMsg.getSenderID(), initReqMsg.getInitWindow());
        exportThreadPool.execute(() -> {
          Thread.currentThread().setName(exportThread.getName());
          exportThread.run();
          Thread.currentThread().setName(exportTask.getName());
          exportTask.run();
        });
      }
    }
@@ -1039,20 +1040,23 @@
   */

  /**
   * This thread is launched when we want to export data to another server.
   * This task is submitted to the export thread pool when we want to export data to another
   * server.
   *
   * When a task is created locally (so this local server is the initiator)
   * of the export (Example: dsreplication initialize-all),
   * this thread is NOT used but the task thread is running the export instead).
   * this task is NOT used but the task thread is running the export instead).
   */
  private class ExportThread extends DirectoryThread
  private class ExportTask implements Runnable
  {
    /** Id of server that will be initialized. */
    private final int serverIdToInitialize;
    private final int initWindow;
    /** Name given to the pool thread which runs this task. */
    private final String name;

    /**
     * Constructor for the ExportThread.
     * Constructor for the ExportTask.
     *
     * @param serverIdToInitialize
     *          serverId of server that will receive entries
@@ -1060,14 +1064,24 @@
     *          The value of the initialization window for flow control between
     *          the importer and the exporter.
     */
    public ExportThread(int serverIdToInitialize, int initWindow)
    public ExportTask(int serverIdToInitialize, int initWindow)
    {
      super("Export thread from serverId=" + getServerId() + " to serverId="
          + serverIdToInitialize);
      this.name = "Export thread from serverId=" + getServerId() + " to serverId="
          + serverIdToInitialize;
      this.serverIdToInitialize = serverIdToInitialize;
      this.initWindow = initWindow;
    }

    /**
     * Returns the name of this task, used to name the thread running it.
     *
     * @return the name of this task
     */
    public String getName()
    {
      return name;
    }

    @Override
    public void run()
    {

 opendj-server-legacy/src/main/java/org/opends/server/tools/LDAPConnectionOptions.java

@@ -13,6 +13,7 @@
 *
 * Copyright 2006-2008 Sun Microsystems, Inc.
 * Portions Copyright 2015 ForgeRock AS.
 * Portions Copyright 2026 3A Systems, LLC.
 */
package org.opends.server.tools;

@@ -174,6 +175,9 @@

  /**
   * Get the SASL options used for authentication.
   * <p>
   * The returned map is the live set of properties: callers may add or remove properties
   * through it, as the DSML gateway does when it drops the authorization identity.
   *
   * @return  The SASL options used for authentication.
   */